Le attività di ricerca del Dipartimento sono portate avanti da 12 Istituti con sedi distribuite sulla gran parte del territorio italiano.
- Istituto per lo studio degli impatti Antropici e Sostenibilità in ambiente marino (IAS)
- Istituto sull’inquinamento atmosferico (IIA)
- Istituto di geologia ambientale e geoingegneria (IGAG)
- Istituto di geoscienze e georisorse (IGG)
- Istituto di metodologie per l’analisi ambientale (IMAA)
- Istituto per le Risorse Biologiche e le Biotecnologie Marine (IRBIM)
- Istituto di Ricerca sugli Ecosistemi Terrestri (IRET)
- Istituto di Ricerca sulle Acque (IRSA)
- Istituto di Ricerca per la Protezione Idrogeologica (IRPI)
- Istituto di scienze dell’atmosfera e del clima (ISAC)
- Istituto di scienze marine (ISMAR)
- Istituto di Scienze Polari (ISP)